近期,我所在胡椒生长发育和开花调控关键转录因子基因研究方面取得新进展,不仅丰富了对胡椒生长发育过程调控的认知,也为胡椒分子育种提供了重要参考。
SBP-box基因家族是一类植物特有的转录因子基因家族,其在开花植物中发挥至关重要的调控作用,不仅通过调控MADS基因的表达在开花调控中发挥重要作用,而且在植物形态、果实发育和成熟方面也起到作用。胡椒研究团队在前期胡椒染色体级别精细基因组组装基础上,通过对胡椒全基因组范围的生物信息学鉴定,得到34个PnSBP基因,获得8个胡椒SBP基因分组,其中1个胡椒分组在拟南芥中缺失。一半的胡椒SBP基因存在miR156靶位点,并且在胡椒中预测得到了17个miR156基因。另外,研究人员通过组织表达谱分析了胡椒SBP基因的表达特征,并且利用共表达网络初步揭示了胡椒SBP基因的潜在功能。
上述研究以题为“Genome-wide Identification and Functional Exploration of SBP-box Gene Family in Black Pepper (Piper nigrum L.)”的研究论文发表于遗传学领域期刊《genes》。中国热科院香饮所热带香辛饮料种质资源研究室的李靖助理研究员为该论文的第一作者,通讯作者为郝朝运研究员。此项研究得到了院本级科研业务费和海南省自然科学基金的资助。
胡椒SBP-box基因家族和miR156的系统发育树及胡椒SBP基因的功能分析
论文连接https://www.mdpi.com/2073-4425/12/11/1740